
Jackie Stewart i Ken Tyrrellov Matra-Ford tim dolaze do šampionskih titula, jer niko nije mogao da im parira. Od samog početka sezone je bilo izvesno, da će Stewart biti čovek koji će se boriti za titulu.
Jackie Stewart je prošle godine bio veoma blizu, osvajanju šampionske titule, a početkom 1969. je sve krenulo svojim putem. Matra je povukla svoj tim, tako da su sve snage usmerene na Tyrrellovu ekipu. Stewartu i Johnny Servoz-Gavinu se pridružio Jean-Pierre Beltoise.
Rindt je iskoristio priliku i pridružio se Graham Hillu u Team Lotusu, a Ickx je napustio Ferrari i prešao u Brabham. Jack Brabham je konačno odustao od saradnje sa Repcom i prešao na Ford Cosworth motore. Honda krajem 1968. godine odlučuje da napusti Formulu 1, tako da Surtees prelazi u BRM. Pored Honde, sport napuštaju Cooper-Masserati i Eagle-Weslake. Po prvi put se u Formuli 1 pojavljuje tim Frank Williamsa, Frank Williams Racing Cars, koji je koristio Brabhamove bolide.
Stewart je započeo sezonu u veoma dobroj formi, dominacijom na VN Južne Afrike. Mario Andreti, koji je povremeno vozio treći Lotusov bolid, je uspeo da parira Stewartu na početku trke. Stewart dolazi do druge pobede u sezoni na Montjuich Parku, gde se vozila VN Španije. Trka će ostati upamćena po Hillovoj i Rindtovoj nesreći, jer njihova krila nisu funkcionisala.
Rindt je propustio VN Monaka, a FIA je najavila zabranu, visoko montiranih aerododataka. U Monaku su odustali Stewart i Amon, obojica sa liderskih pozicija, što je omogućilo Hillu da dođe do istorijske pobede. Piers Courage je završio na drugom mestu, u privatnom Brabhamu, čiji je vlasnik bio Frank Williams.

Graham Hill pobednik VN Monaka 1969. godine
Trka u Belgiji je otkazana, a Rindt je uspeo da se oporavi na vreme za VN Holandije. Austrijanac je ostvario pol poziciji, a na trci je morao sa liderske pozicije da odustane, tako da Stewart beleži još jednu pobedu. Jackieva četvrta pobeda je došla na Clermont-Ferrandu u Francuskoj, gde je njegov kolega Beltoise završio na drugom mestu.
Stewart je došao do još jedne pobede na Silverstoneu, gde je imao tešku boru sa Rindtom, sve dok Austijanac nije otišao u boks na zamenu krila. Ickx je imao dobru trku i završio je na drugom mestu, a dve nedelje kasnije, na VN Nemačke, je došao do prve pobede u karijeri, a to je ujedno bila i prva pobeda za Brabham tim još od 1967. godine.

VN Holandije 1969. godine, Stewart na liderskoj poziciji
Škot je došao do šeste pobede u sezoni na VN Italije, na legendarnoj stazi Monza. Stewart je završio ispred Rindta, Beltoisea i McLarena. Nakon što je ostavrio šest pobeda, Stewart nije trijumfovao na poslednje tri trke.
Ickx odnosi pobedu u Kanadi, dok Rindt dolazi do prve pobede u karijeri, na Watkins Glenu. Hulme dolazi do pobede u Meksiku, vozeći za McLarenov tim.

Danny Hulme u McLarenu pobeđuje na VN Meksika
Na trci u Meksiku nije učestvovao Graham Hill, jer je na Watkins Glenu polomio nogu. On se sledeće godine vratio trkama, ali više nikad nije pobedio.
| Trka | Staza | Pol pozicija | Pobednik | Konstruktor | |
| 1 | Kyalami | ||||
| 2 | Montjuïc | ||||
| 3 | Monaco | ||||
| 4 | Zandvoort | ||||
| 5 | Charade | ||||
| 6 | Silverstone | ||||
| 7 | Nürburgring | ||||
| 8 | Monza | ||||
| 9 | Mosport Park | ||||
| 10 | Watkins Glen | ||||
| 11 | Hermanos Rodriguez |
| Poz. | Konstruktor | Tim | Poeni |
| 1. | 66 | ||
| 2. | 49 | ||
| 3. | 47 | ||
| 4. | 38 | ||
| 5. | 7 | ||
| 6. | 7 | ||
| - | 0 | ||
| - | 0 | ||
| - | 0 | ||
| - | 0 |
| Poz. | Vozač | Tim | Konstruktor | Poeni |
| 1. | Matra | 63 | ||
| 2. | Brabham | 37 | ||
| 3. | McLaren | 26 | ||
| 4. | Lotus | 22 | ||
| 5. | Matra | 21 | ||
| 6. | McLaren | 20 | ||
| 7. | Lotus | 19 | ||
| 8. | Brabham | 16 | ||
| 9. | Lotus | 15 | ||
| 10. | Brabham | 14 | ||
| 11. | BRM | 6 | ||
| 12. | Ferrari | 4 | ||
| 13. | Lotus | 3 | ||
| 14. | Cooper McLaren |
3 | ||
| 15. | Ferrari BRM |
3 | ||
| 16. | Brabham | 1 | ||
| 17. | BRM | 1 | ||
| 18. | Matra | 1 | ||
| - | Lotus Brabham |
0 | ||
| - | Lotus | 0 | ||
| - | Lotus | 0 | ||
| - | BRM | 0 | ||
| - | Lotus | 0 | ||
| - | Lotus | 0 | ||
| - | BRM | 0 | ||
| - | Brabham | 0 | ||
| - | McLaren | 0 | ||
| - | Lotus Brabham |
0 | ||
| - | McLaren | 0 | ||
| - | Brabham | 0 | ||
| - | Eagle | 0 |